145 件の論文
本研究は、5 層の統合システム解析を用いてリーシュマニア原虫の生活環分化を解明し、転写後制御、特にタンパク質分解が、mRNA 量とタンパク質量の乖離を介して寄生虫の発育に不可欠な役割を果たすことを初めて明らかにしました。
本論文は、出芽酵母のガラクトーススイッチを対象に、染色体配置や小胞体などの細胞内空間構造を考慮した反応拡散モデルを開発し、従来の均一混合仮定に基づくモデルでは見逃されていた空間的ヘテロジニティが遺伝子発現やタンパク質産生の動態に定性的な影響を与えることを実証したものである。
この論文では、NetLogo 上で実装されたエージェントベースモデルを用いて、アクチン重合の動的過程をシミュレーションし、in vitro での重合プロセスの再現だけでなく、F-アクチンフィラメントの全球的なトレッドミリングや核形成と伸長間の競合といった既知の創発パターンを成功裏に再現したことを報告しています。
本論文は、多様な生物学的知識を統合するマルチモーダル深層学習フレームワーク「NEWT」を提案し、これにより創薬における化合物 - ターゲット予測精度の向上と単一細胞レベルでの細胞系統再構築の両立を実現したことを示しています。
この論文は、大規模マルチオミクスデータとAIを統合したフレームワークを開発し、老化および12の加齢関連疾患に共通する治療標的を同定するとともに、IL6やIL6Rなどの遺伝的因果証拠に基づいた創薬・既存薬転用の可能性を提示したものである。